Es gibt viele unterschiedliche Nutzungen: Wasser wird für die Bewässerung landwirtschaftlicher Flächen und für die Gewinnung von Trinkwasser entnommen, gereinigtes Abwasser aus Kläranlagen von Kommunen, Haushalten oder Industrie wird in die Gewässer eingeleitet, Güter werden via Schiff transportiert oder die Energie aus der Kraft des Wassers gewonnen.
Zusätzlich wurden und werden Gewässer auch in ihrer natürlichen Gestalt verändert, begradigt oder verlegt, um beispielsweise Platz für Gewerbe oder Siedlungen zu schaffen. Gewässer werden auch indirekt genutzt: So gelangen Stoffe zum Beispiel durch Verbrennungsprozesse in die Luft und durch Regenwasser in die Gewässer und den Boden. Jede dieser unmittelbaren oder indirekt wirkenden Aktivitäten kann für ein Gewässer zur Belastung werden und weitreichende Folgen haben.